L’ISS allarga l’indagine sulle varianti del virus. Come si svolgeranno i nuovi test

L’Istituto Superiore di Sanità, come anticipato nei giorni scorsi, sta avviando la seconda indagine rapida per delineare il livello di diffusione delle varianti del virus SARS-CoV-2 su tutto il territorio italiano, allargando l’accertamento alle tre varianti principali già identificate nel nostro Paese – inglese, brasiliana e sudafricana – dopo la prima mappatura di dieci giorni fa che si era concentrata soltanto sulla variante inglese.

La nuova indagine sarà coordinata dall’ISS col supporto della Fondazione Kessler e la collaborazione del Ministero della Salute e delle Regioni e le Province Autonome italiane, chiamate ad analizzare nuovamente alcuni tra tamponi molecolari risultati positivi nella giornata del 18 febbraio 2021, e prelevati nei due giorni precedenti, con particolare attenzione alle tre varianti in circolazione in Italia.

La divisione in 4 macroaree per la nuova indagine dell’ISS

Per questa seconda indagine si è deciso di procedere in modo differente rispetto a quella precedente. L’Italia è stata divisa in quattro macroaree e i campioni da rianalizzare saranno 1.058, un numero deciso in base alla percentuale di casi positivi notificati dalle Regioni e Province Autonome il 16 febbraio scorso:

Nord-Ovest, 265 campioni

• Piemonte: 76
• Valle d’Aosta: 1
• Liguria: 22
• Lombardia: 167

Nord-Est, 266 campioni

• Bolzano: 57
• Trento: 20
• Friuli Venezia Giulia: 27
• Emilia-Romagna: 97
• Veneto: 64

Centro, 254 campioni

• Lazio: 123
• Marche: 38
• Umbria: 32
• Toscana: 61

Sud e Isole, 273 campioni

• Abruzzo: 42
• Basilicata: 7
• Calabria: 11
• Campania: 95
• Molise: 1
• Puglia: 58
• Sardegna: 6
• Sicilia: 53

I campioni da rianalizzare alla ricerca delle varianti del virus

Ogni Regione e Provincia Autonoma dovrà scegliere i campioni da analizzare in maniera causale tra quelli risultati positivi, garantendo se possibile – e questo non vale per Valle D’Aosta o Molise che hanno un solo campione da analizzare – una rappresentatività geografica e per fasce di età.

La nuova analisi dei campioni dovrà essere svolta tramite sequenziamento Sanger dell’intero gene S (spike) oppure con sequenziamento di parte del gene S o, ancora, tramite sequenziamento in NGS purché siano identificate tutte le mutazioni/delezioni attribuibili a una delle tre varianti del virus.

I dati raccolti dovranno essere inviati all’Istituto Superiore di Sanità, tramite la piattaforma della Sorveglianza Integrata COVID-19, entro le 12.00 del 1° marzo 2021. La panoramica che ne uscirà ci darà un’indicazione sommaria del livello di diffusione in Italia della variante brasiliana e sudafricana del virus, ma anche e soprattutto di fare un confronto con la fotografia sulla diffusione di quella inglese, pari al 17,8% secondo i dati dei primi giorni di febbraio.